Dans le cadre du projet de recherche CGI-Clinics (Cancer Genome Interpreter) concernant l'interprétation du génome du cancer basé sur les données pour le traitement personnalisé du cancer , les missions de la personne recrutée, en tant que Chef.ffe de projet scientifique consisteront notamment à :
- Structurer, à Gustave Roussy (GR) et dans le cadre du projet, l’interprétation des données sur le génome du cancer et les initiatives de partage de données, sous différents angles (recherche, réglementation, éthique, oncologie médicale) ;
- Assurer le rôle de personne ressource pour l’outil CGI au sein de Gustave Roussy et faire le lien avec les autres bases de variants ;
- S’assurer, au cours de l’étape de validation, que toutes les mesures sont enregistrées afin de comparer la pratique clinique actuelle et les résultats de l’outil CGI ;
- Veiller à la mise en œuvre des paramètres prédéfinis de l’outil ;
- Apprendre à maîtriser le CGI en tant qu’utilisateur (par exemple : introduire des mutations, formater les données, comprendre les rapports et les traitements/essais cliniques proposés) ;
- Identifier les besoins médicaux pour l’utilisation de la base CGI Clinics et les indicateurs de performance (KPI), avec l’appui d’un partenaire en économie de la santé ;
- Participer à des journées d’information, des événements de partenariat et de jumelage dans son pays de base, ainsi qu’à des séances d’information, etc. ;
- Identifier et promouvoir les ajustements les plus appropriés dans le plan d’action, afin d’aligner les résultats avec les objectifs du projet, en lien avec les outils de GR (capacité d’adaptation et approche de résolution de problèmes) ;
- Aider les oncologues et biologistes médicaux à GR dans le cadre du projet à utiliser l’outil CGI-Clinics dans la prise de décision pour les tumeurs caractérisées sur le plan moléculaire (RCP moléculaire) ;
- Recueillir les données cliniques et génomiques des patients inclus dans le projet CGI-Clinics (mises à jour rétrospectives et/ou de suivi) ;
- Intégrer enfin l’outil CGI dans le flux diagnostique.
- Formation en informatique / data management
- Des connaissances en IA et en modèles de langage de type LLM seraient appréciées.
- Très bonne connaissance sur la génétique humaine et les variants génétiques
- Expérience en interprétation des données génomiques du cancer et en bases de variants
- Intérêt marqué pour l’intégration des données moléculaires dans la décision thérapeutique (RCP moléculaire, essais cliniques)
- Aptitude à paramétrer, valider et intégrer des outils numériques d’aide à la décision dans le flux diagnostique
- Compétences en recueil, structuration et harmonisation de données cliniques et génomiques de patients
- Capacité à collaborer en environnement pluridisciplinaire internationale (oncologie, bio-informatique, économie de la santé) et à jouer un rôle de “personne ressource”
- Habitude de participer à des actions de formation, d’information et de diffusion autour des outils de génomique en oncologie.
- Anglais courant